Historie w grze skupia się wokół Tidusa, gwiazdy sportu zwanego blitzball, mieszkającego w mieście Zanarkand. Podczas rozgrywanego meczu, na miasto napada potężny potwór nazywany Sinem, w wyniku czego zostaje ono doszczętnie zniszczone. Tidus wraz z Auronem – przyjacielem swojego ojca – przeżywają jako jedni z nielicznych, jednakże w niezbyt jasnych okolicznościach przedostają się do odległej o tysiąc lat przyszłości. Bohater dowiaduje się także iż mimo tak dużego upływu czasu, technika nie dość że nie poszła do przodu, to ludzkość w ogóle z niej przestała korzystać. Powodem takiego stanu rzeczy jest nowa religia – Yawonu, które zakazuje korzystania z dobrodziejstw techniki. Okazuje się także że stwór który zniszczył rodzinne miasto bohatera, nadal istnieje, nieustannie siejąc grozę, a ludzie trwają w przekonaniu iż jego ataki są karą za korzystanie ze zdobyczy techniki.

Źródło: Wikipedia (autorzy, na licencji CC-BY-SA 3.0)